تقوم إدارة البرامج و العقود بالإشراف على توحيد الإجراءات المالية والإدارية في البرامج وإعداد شروط مواصفات التشغيل ومراجعة وتدقيق التكاليف الإدارية والتوظيف والتشغيل ووضع معايير الرقابة المالية بالتنسيق مع إدارة الشئون المالية بالخدمات الطبية بالإضافة إلي الإشراف والرقابة المالية على حسابات العلاج بمستشفيات الخدمات الطبية.